Guarda, a livello di termodinamica non saprei bene come trattare il problema, ma credo che una componente importante nella riuscita di un caffè stia anche nel processo di percolazione
(wikipedia in italiano
https://it.wikipedia.org/wiki/Percolazione o ancora meglio in inglese
https://en.wikipedia.org/wiki/Percolation , dove c'è anche l'esempio del caffè) che ha una notevole rilevanza in diversi ambiti della scienza e dell'ingegneria. Di fatto dietro c'è un'intera teoria matematica (teoria della percolazione:
https://en.wikipedia.org/wiki/Percolation_theory ), e spesso il fenomeno si modellizza attraverso simulazioni computazionali. Non ho mai approfondito troppo la faccenda, per mancanza di tempo, ma mi sembra decisamente interessante. Insomma, più che un problema di termodinamica, credo che il caffè sia proprio una questione di meccanica statistica, e neanche troppo banale
PS: Non è "per colazione", è proprio "percolazione", si scrive tutto attaccato