Problema con la funzione fanny in R

Messaggioda anonymous_c046ce » 02/09/2015, 10:21

Ciao. Ho un problema con la funzione fanny di R.
Infatti vorrei applicare il metodo fuzzy c means con questo codice ma non riesco a farlo:
Il codice è:
“require(cluster)
data1 <- read.table(file='C:\\Users\\Alberto\\Desktop\\Fuzzy_Clustering\\Dati_SPSS_Cluster_1.csv', sep=',', header=T)
x <- as.matrix(data1)
fanny(x, 2, memb.exp = 2,metric = c("euclidean"),stand = FALSE,maxit = 500, tol = 1e-15, trace.lev = 0)”
La replica del programma all’invio su questo codice è:
“Error in fanny(x, 2, memb.exp = 2, metric = c("euclidean"), stand = FALSE, : x is not a numeric dataframe or matrix.”
Quale potrebbe essere il problema?
Come se x, che è la variabile a cui ho assegnato il valore “data1” cioè il file di Excel in formato csv che contiene il dataset delle osservazioni, non fosse una matrice. In realtà è una matrice perché è la conversione in matrice del dataset numerico data1. Almeno dovrebbe esserlo. Infatti il comando as.matrix non serve a questo?
anonymous_c046ce
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Re: Problema con la funzione fanny in R

Messaggioda bassi0902 » 02/09/2015, 10:43

Potrebbero esserci dei valori non numerici in x, infatti il messaggio dice che x non é un dataframe o matrice numerica.
Probabilmente importando i dati da excel ti sarai tirato dietro qualche NA o valore di tipo char. Prova a controllare...
bassi0902
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Re: Problema con la funzione fanny in R

Messaggioda anonymous_c046ce » 02/09/2015, 10:55

Ti ringrazio tantissimo per l'aiuto.

In effetti ci sono dei valori numerici. Sono le intestazioni delle colonne numeriche in Excel. Allora cosa faccio?
anonymous_c046ce
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Re: Problema con la funzione fanny in R

Messaggioda anonymous_c046ce » 02/09/2015, 10:58

Ti ringrazio tantissimo per l’aiuto.
In effetti ci sono le intestazioni delle colonne numeriche. Come faccio ad eliminarle?
Le elimino direttamente dal file Excel? Oppure?
anonymous_c046ce
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Re: Problema con la funzione fanny in R

Messaggioda bassi0902 » 02/09/2015, 11:04

Hai provato a passargli direttamente "data1" (cioé senza fare as.matrix) ? Perché data1 é giá un data frame, quindi magari funziona... non ho capito dove sono le intestazioni delle colonne, solo nella prima riga?
bassi0902
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Re: Problema con la funzione fanny in R

Messaggioda anonymous_c046ce » 02/09/2015, 11:12

Perfetto! Ora funziona! Grazie!
Ora una curiosità a questo punto.
Io ho trovato in un documento su Internet la funzione as. matrix per convertire il dataframe in una matrice. A cosa serve?
Mi chiedo a che serva visto che basta leggere la tavola con read.table ed è già una matrice.
Oltretutto mi ha fatto pure sbagliare.
anonymous_c046ce
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Re: Problema con la funzione fanny in R

Messaggioda bassi0902 » 02/09/2015, 12:03

La funzione as.matrix rende una matrice ció che non lo é secondo R. Se hai un vettore di 100 valori ad esempio, puoi salvarlo come una matrice 10x10 con il comando as.matrix(...) specificandogli le dimensioni. Questo é solo un esempio... ci sono tanti altre occasioni in cui puó essere utile...
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